Drogę do odbudowy struktur organizacyjnych Kurkowych Bractw Strzeleckich, zrzeszonych później w Zjednoczeniu Kurkowych Bractw Strzeleckich Rzeczypospolitej Polskiej, stworzyła ustawa sejmowa z dnia 7 kwietnia 1989 roku “Prawo o stowarzyszeniach” (Dz.U. nr 20 poz. 104).
W 1999 roku oficer Wyższej Szkoły Oficerskiej w Toruniu, Mariusz Michalski, którego ojciec utworzył w Piechcinie Kurkowe Bractwo Strzeleckie, zainteresował się historią Bractwa w Toruniu.
W końcu stycznia 1999 roku grupa inicjatywna reaktywowania w Toruniu Kurkowego Bractwa Strzeleckiego liczyła już 30 osób. W jej skład wchodzili: Jerzy Okoński, Mariusz Michalski, Waldemar Więcaszek, Hieronim Gorzkiewicz, Roman Podlewski, Antoni Blin, Franciszek Pokojski, Krzysztof Rauhut, Roman Kannenberg, Stefan Lewandowski, Leszek Polak, Lucjan Przewiężlikowski, Andrzej Bartkowski, Ireneusz Huzarski, Kazimierz Cieszkowski, Władysław Kołybski, Andrzej Sztejn, Jan Szpak, Piotr Kierzkowski, Piotr Tobolewski, Grzegorz Sawicki, Andrzej Szlendak, Jerzy Rzepecki, Mariusz Huzarski, Waldemar Królikowski, Andrzej Płachciński, Mariusz Thomas, Jan Tuaor, Marek Marconi i Jerzy Jagielski. Na nieformalnych spotkaniach w styczniu 1999 roku w Forcie IV dyskutowano o działalności ruchu brackiego w Polsce, tradycjach i zwyczajach brackich oraz rozważano koncepcje utworzenia i kierunki działania przyszłego Bractwa Kurkowego. Wszyscy byli zgodni, że powinno ono kontynuować tradycje istniejącego do 1939 roku toruńskiego Kurkowego Bractwa Strzeleckiego.
W dniu 29 stycznia 1999 roku podczas spotkania tej grupy w Forcie IV podjęto decyzję o reaktywowaniu Kurkowego Bractwa Strzeleckiego w Toruniu.
Pomimo, że Bractwo jeszcze formalnie nie istniało, postanowiono dla uczczenia rocznicy Konstytucji 3-go Maja, właśnie w dniu 3 maja 1999 roku, zorganizować w Forcie IV pierwsze oficjalne strzelanie. Wzorując się na przedwojennym Kurkowym Bractwie Strzeleckim połączono je ze Strzelaniem Królewskim.
Dnia 31 maja 1999 roku wysłano do Sądu Okręgowego w Toruniu wniosek o zarejestrowanie stowarzyszenia pod nazwą Kurkowe Bractwo Strzeleckie w Toruniu. Reaktywowane Bractwo zostało wpisane do rejestru stowarzyszeń pod numerem St. „A” 777 w dniu 21 lipca 1999 roku.
W dniu 18 września 1999 roku odbyło się pierwsze od 1939 roku Walne Zebranie Członków reaktywowanego Kurkowego Bractwa Strzeleckiego. Oprócz członków Bractwa uczestniczył w nim Prezydent Miasta Torunia Wojciech Grochowski oraz prezes Pomorskiego Okręgu KBS Lech Magnuszewski.
W dniach 25 i 26 września 1999 roku delegacja Bractwa w składzie: Jerzy Rzepecki i Jerzy Jagielski, uczestniczyła w Krajowym Zjeździe Delegatów Zjednoczenia Kurkowych Bractw Strzeleckich RP w Szamotułach, gdzie złożyła wniosek o przyjęcie toruńskiego Bractwa w szeregi Zjednoczenia.
Do końca roku zorganizowano jeszcze 3 strzelania. W dniu 23 października odbyło się strzelanie o tytuł Króla Żniwnego. Zwyciężył brat Władysław Kołybski przed Mariuszem Michalskim i Andrzejem Szlendakiem. W listopadzie odbyły się strzelania Niepodległościowe i Andrzejkowe.